鼠尾鉴定试剂盒使用说明 Mouse Genotyping Kit
产品简介
本试剂盒专用于小鼠基因型的快速鉴定。仅需 1-2mm 小鼠尾部组织或脚趾,短短 15 分钟即可获取足够量的 DNA 模板直接用于 PCR 反应,无需抽提与纯化。未提纯的 DNA 样品含有许多 PCR 抑制成分,对 PCR 酶的兼容性有很大要求。本试剂盒中配套的 DirectAmp PCR Mix 经过优化,对未提纯模板中的抑制成分有很强的耐受性,可兼容未提纯 DNA模板,实现一步法 PCR 鉴定。DirectAmp PCR Mix 中含有 loading dye,PCR 后可直接跑凝胶电泳,省时方便。
产品优势
- 更少的样品量:仅需1-2mm小鼠尾部组织或脚趾;
- 更快捷的操作:仅需15min极速完成样品处理,允许96孔板高通量操作;
- 更兼容的PCR体系:产品中的DirectAmp PCR Mix经独家优化,对未提纯模板中的抑制成分有很强的耐受性,DNA模板无需抽提纯化,且PCR产物可直接跑凝胶,实现一步法PCR鉴定。
- 更长的扩增片段:目的片段扩增长度可达3 k,区别于市面上的2k以内。
试剂盒组成:
组分 | 500次 | 1000次 | 储存温度 |
Tail Lysis | 25 mL | 50 mL | 4℃ |
DirectAmp PCR Mix | 5 mL | 10 mL | -20℃ |
实验前准备
镊子,手术剪,PCR 管/PCR 8 联管/96 孔 PCR 板,单道移液器/多道移液器,PCR 扩增仪,恒温金属(水)浴,小型高速离心机
鼠尾裂解释放 DNA
1)散管操作
1 准备好镊子和手术剪,75%的乙醇喷洗消毒。
2 剪取 1-2 mm 鼠尾,用镊子夹到 PCR 管/ PCR 8 联管中,加 50 μL Tail Lysis,裂解液需没过鼠尾。
3 将 PCR 管放到 95℃金属浴中或者PCR仪中,孵育 15 min-30 min。
注意:若样品为脚趾,孵育时间建议设置为 30 min。
4 把上清液移至 8 联管或者 96 孔 PCR 板中存放,样品可直接进行 PCR 实验,若暂时不使用,可保存在-20 冰箱中(也可直接吸取上清加入到PCR体系中)。
2)96 孔板高通量操作
1 准备好镊子和手术剪,75%的乙醇喷洗消毒。
2 剪取 1-2 mm 鼠尾,用镊子夹到 96 孔 PCR 板,加 50μL Tail Lysis,裂解液需没过鼠尾。
3 将 96 孔 PCR 板放到 PCR 仪中,95℃,孵育 15 min-30 min。
注意:若样品为脚趾,孵育时间建议设置为 30 min。
4 把上清液移至新的 96 孔 PCR 板中存放,样品可直接进行 PCR 实验,若暂时不使用,可保存在-20冰箱中。
PCR 鉴定
将 DirectAmp PCR Mix从-20℃冰箱取出,放置在冰盒中融解,按照下表配制 PCR 体系:
表 1. 实验样品配制体系
试剂 | 体积(每反应) |
DirectAmp PCR Mix,2X | 10 μL |
鼠尾裂解产物 | 1 μL |
鉴定引物 F(10 μM) | 0.5 μL |
鉴定引物 R(10 μM) | 0.5 μL |
ddH2O | 8 μL |
总体积 | 20 μL |
PCR 反应程序如下表:
表 2. PCR 鉴定程序
步骤 | 温度 | 时间 | 循环 |
预变性 | 95℃ | 3min | 1 cycle |
循环扩增 | 95℃ | 15s | 35~40 cycles |
60℃ | 15s | ||
72℃ | 1min/kb | ||
延伸补偿 | 72℃ | 5min | 1 cycle |
PCR 产物可直接点样跑琼脂糖凝胶(不需加 Loading Buffer),或者送 Sanger 测序。
常见问题
① 鼠尾没有裂解完,是否会有影响?
裂解 15 min 后鼠尾还有未裂解完部分,但此时已裂解的样品释放出足够的基因组 DNA 可供后续实验了。若样品为脚趾这类带有较硬难消化的组织,可把时间延长至 30 min。
② PCR 产物少或没有目的条带?
a)裂解后可以转移上清弃沉淀,裂解液中的杂质抑制了 PCR 反应。
b)裂解液中的 DNA 含量太多,可通过稀释裂解液模板解决;或者DNA含量较少,可延长裂解时间,或者增加模板量。
c)引物设计问题。引物与模板不匹配,或者设计时没有注意引物的 GC 含量、二级结构、二聚体、退火温度、长度、特异性等方面的问题。
d)扩增序列 GC 含量偏高。在 PCR 体系中添加 GC Buffer 或者 DMSO 等变性剂,帮助打开模板链,降低 PCR 扩增难度。
③ 可以使用其他的 PCR 酶进行鉴定吗?
本试剂盒 Tail Lysis 处理后的样品为粗提核酸样品,便于进行微量细胞的基因组提取和高通量操作,但由于未经过纯化,不能兼容所有的 PCR 试剂,推荐配套的鉴定试剂 DirectAmp PCR Mix。
④ 可以扩增多大的片段?
由于粗提样本中含有抑制 PCR 反应的因子,会影响 PCR 酶的活性,建议扩增片段长度设计在 3k 以内。(如需扩增更大片段或者复杂序列请联系技术人员)